Geleneksel Aikido, Azerbaycan’da ilk olarak 1990’ların başında öğretilmeye başlandı. Azerbaycan’da Aikido’nun kurucusu Sensei Farhad Alasgarov’dur. Sensei Farhad Alasgarov, 1990’ların başında Bakü’de Azerbaycan’daki ilk Aikido Dojo’sunu kurdu ve eğitime başladı. 30.06.1992 tarihinde, Azerbaycan’daki ilk Aikido organizasyonu olan “Aikido Merkezi”, Adalet Bakanlığı’na kayıt edildi. Azerbaycan’da Aikido için kurulan ilk kamu kuruluşu Azerbaycan Aikido Federasyonu’dur. Federasyon, 13 Temmuz 1994 tarihinde Azerbaycan Cumhuriyeti Adalet Bakanlığı’na kayıt edildi. Federasyonun başkanı Sensei Farhad Alasgarov’dur. Bugüne kadar Azerbaycan’da kurulan ve faaliyet gösteren diğer Aikido organizasyonlarının liderleri ve antrenörleri Federasyonun mezunlarıdır. Federasyon başkanı Sensei Farhad Alasgarov, aynı zamanda federasyonun teknik direktörü ve Azerbaycan Aikido Merkezi’nin başkanıdır. Sensei Farhad Alaskarov’a Azerbaycan Cumhuriyeti Onursal Antrenörü unvanı verildi. 2011 yılında Azerbaycan Aikido Federasyonu, Aikido’nun kurucusu O Sensei Morihei Ueshiba’nın halefi olan Aikido Hombu Dojo, Aikikai Vakfı ve Dünya Aikido Merkezi ile tüm bağlarını kopardı ve ulusal Aikido tarzında özel faaliyetlere başladı. 2012 yılında Gençlik ve Spor Bakanlığı federasyonları yeniden akredite ettiğinde, Azerbaycan Aikido Federasyonu akreditasyonu geçemedi ve federasyon statüsünü kaybetti. Bununla birlikte, Azerbaycan Aikido Federasyonu, mevzuata uygun olarak, Azerbaycan Cumhuriyeti Adalet Bakanlığı’ndaki devlet kayıtlarında federasyon adını korumakta ve faaliyetlerine devam etmektedir.

Azerbaycan Aikikai Aikido Kulüpleri Kamu Birliği Başkanı İlham Guliyev’in önderliğinde, Ekim 2011’den bu yana Aikikai Vakfı Dünya Aikido Genel Merkezi ile ilişkiler kurulmuştur. Aikido Hombu Dojo eğitmeni Kuribayashi Takanori Shihan’ın önderliğinde Azerbaycan Aikido’sunda yeni bir tarih yazılmıştır. 1 Aralık 2017’de, birlik, gerçekleştirdiği faaliyetler nedeniyle Aikikai Vakfı tarafından tanınmıştır. 13 Ekim 2021’de Uluslararası Aikido Federasyonu’nun 13. Aikido Kongresi’nde Azerbaycan üyeliğe kabul edilmiş ve Aikikai Aikido Kulüpleri Kamu Birliği ülkede temsilcilik statüsü kazanmıştır.

Şu anda Azerbaycan’da Aikikai Vakfı Dünya Aikido Genel Merkezi’ne üye olan 3 (üç) Aikido Organizasyonu faaliyet göstermektedir. Bu organizasyonlar Azerbaycan Aikikai Aikido Kulüpleri Kamu Birliği (Başkan İlham Guliyev 6. Dan), Azerbaycan Sakura Aikido Okulu Limited Şirketi (Direktör Tural Süleymanli 3. Dan) ve Azerbaycan Mugenryu Kobudo Spor Kulübü Kamu Birliği’dir (Başkan Bakhtiyar Zeynalov 4. Dan).